答案：

B

解析：

A、因原子變為離子時要得到或失去電子，則同zhi種元素的原子和離子的電子數不同，故A錯誤;

B、因質子在原子核內，電子在核外，當原子變為離子，變化的只是核外的電子數，質子數不變，則同種元素的原子和離子一定具有相同的質子數，故B正確;

C、因金屬失電子變為離子，金屬元素的原子的電子層數大于離子的電子層數，而非金屬元素的原子變為離子要得到電子，但電子層數不變，即同種元素的原子和離子的電子層數可能相同，也可能不同，故C錯誤;

D、因原子變為離子時要得到或失去電子，則由原子變成離子最外層電子數一定發生變化，故D錯誤.

故選B.