答案：A

解析：注意本題中的時間信息“清初”，那時的中國仍處于傳統社會，不存在資本市場（因為資本市場是近代社會的產物），故排除B項。
自然經濟受到沖擊是鴉片戰爭以后才開始的（可聯系“鴉片戰爭后中國經濟結構的變動”這一知識點幫助判斷），故排除C項。
題干材料反映外國貨幣涌入中國，并沒有涉及民間貿易發展沖擊清朝統治內容，故D項與題意無關，應排除。
外來貨幣涌入，這表明中國的對外貿易出超明顯，中國在對外貿易中處于優勢地位，可知正確選項為A項。
故選：A。
本題考查古代中國商業的發展。考查清代商品經濟的發展（對外貿易），學生解讀史料獲取信息、運用所學知識解決問題的能力。
本題是易錯題，主要是對明清時期對外貿易知識的掌握不全面。中國對外貿易在當時領先世界，可以說是世界貿易的中心，主要交易物是絲綢、瓷器等中國特產，銷量極大，大量白銀流入中國。也可聯系鴉片戰爭的歷史背景，鴉片戰爭前，在中英對外貿易中中國處于出超地位這一知識點。